سازمان برنامه و بودجه در سال ۱۳۲۷ براي نخستينبار با تصويب برنامه هفتساله عمراني اول با نام سازمان برنامه پايهگذاري شد.
خبر اقتصادی -سازمان مديريت و برنامهريزي از ادغام دو سازمان با عناوين، سازمان امور اداري و استخدامي كشور و سازمان برنامه و بودجه مطابق مصوبه ۱۶اسفند ۱۳۷۸ شوراي عالي اداري، تاسيس و در ۱۷تير ۱۳۷۹ نمودار تشكيلاتي آن تصويب و به اجرا در آمد. پس از انحلال اين سازمان در سال ۱۳۸۶ به دستور احمدينژاد معاونت برنامهريزي و نظارت راهبردي تاسيس شد و بخشي از وظايف آن را برعهده گرفت. باتوجه به مشكلاتي كه بر اثر انحلال اين سازمان در دوران دولت نهم و دهم رخ داد، با انتخاب حسن روحاني بهعنوان رييسجمهور ايران، وي در نخستين نشست خبري خود اعلام كرد كه سازمان را احيا ميكند. در روز ۲۸خرداد (سه روز پس از انتخاب روحاني بهعنوان رياستجمهوري)، مجلس شوراي اسلامي ايران يك فوريت احياي سازمان مديريت را تصويب كرد. اكنون نيز با دستور روحاني سازمان مديريت و برنامهريزي احيا شده است.