در مرحله دوم هدفمند سازی یارانه ها، اصلاح قیمت حامل های انرژی از جمله نفت سفید، نفت کوره، سی ان جی و گاز طبیعی در دستورکار است اما قیمت آرد و نان و گندم افزایش پیدا نخواهد کرد و قیمت حامل های پایه انرژی مثل بنزین، گازوئیل، نفت کوره بر اساس قیمت خلیج فارس محاسبه خواهد شد.